Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms