Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms