Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ctdsp1P58466 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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