Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dpf3P58269 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dpf3P58269 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms