Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bace1P56818 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms