Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5bP56480 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms