Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp1P55194 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sh3bp1P55194 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3bp1P55194 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms