Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PctpP53808 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PctpP53808 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms