Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms