Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr5P51682 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr5P51682 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr5P51682 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr5P51682 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccr5P51682 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms