Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtshP49935 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtshP49935 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtshP49935 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtshP49935 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtshP49935 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtshP49935 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtshP49935 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtshP49935 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtshP49935 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtshP49935 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtshP49935 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtshP49935 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtshP49935 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtshP49935 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CtshP49935 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtshP49935 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms