Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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