Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col18a1P39061 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms