Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms