Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms