Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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