Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BgnP28653 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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