Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms