Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms