Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms