Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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