Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo2P25801 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms