Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HdcP23738 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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