Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms