Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NefhP19246 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NefhP19246 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms