Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms