Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sdc1P18828 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms