Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DmdP11531 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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DmdP11531 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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DmdP11531 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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DmdP11531 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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DmdP11531 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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DmdP11531 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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DmdP11531 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DmdP11531 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DmdP11531 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms