Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp1P11438 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms