Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01755 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01755 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms