Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CopeO89079 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CopeO89079 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CopeO89079 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CopeO89079 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CopeO89079 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CopeO89079 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CopeO89079 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CopeO89079 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CopeO89079 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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