Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sap30O88574 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms