Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms