Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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