Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdmt1O55055 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms