Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn9O35239 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn9O35239 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms