Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms