Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hps1O08983 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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