Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3542K7N6U2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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