Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm2035J3QP87 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm2035J3QP87 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm2035J3QP87 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm2035J3QP87 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm2035J3QP87 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2035J3QP87 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm2035J3QP87 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm2035J3QP87 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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