Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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