Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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