Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28051J3QMA2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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