Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms