Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms