Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20815J3KMI0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20815J3KMI0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20815J3KMI0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20815J3KMI0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm20815J3KMI0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm20815J3KMI0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm20815J3KMI0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm20815J3KMI0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20815J3KMI0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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