Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sclt1G5E861 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms