Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms