Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms