Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc146E9Q9F7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc146E9Q9F7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc146E9Q9F7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc146E9Q9F7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc146E9Q9F7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc146E9Q9F7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc146E9Q9F7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms